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La forma más cómoda y rápida de llegar a los distintos puntos turísticas de la Patagonia es a través de sus vuelos regulares.
Existen doce aeropuertos ubicados en la Patagonia tanto en la zona cordillerana como en la costa atlántica. Estos son: Bariloche, Calafate, Comodoro Rivadavia, Esquel, Chapelco, Neuquén, Puerto Madryn, Río Gallegos, Río Grande, Trelew, Ushuaia y Viedma.
Bariloche, ubicada en Río Negro, es el centro más importante de acceso tanto a las pistas de ski como a los Parques Nacionales de Los Arrayanes y Nahuel Huapí. También la ruta de los siete lagos, que va de Bariloche hasta San Martín de los Andes en Neuquén. El vuelo dura aproximadamente dos horas.
Los aeropuertos de Chapelco, Nequén y Esquel son los destinos indicados para comenzar el viaje por los Parques Nacionales Lanín y Nauhel Huapí para luego bajar hacia San Martín de los Andes y Bariloche. También para arribar al Centro de ski Chapelco, uno de los más importantes de la región.
Puerto Madryn, en cambio, es el mayor centro de acceso a los atractivos atlánticos de la Patagonia Argentina. La ciudad bordea la costa playas de arena y otras canto rodado. Su especialidad gastronómica son los mariscos y bivalvos y cuenta además con un casino. Muy cerca, para recorrer en auto o en tour, se encuentra la Península de Valdés, centro de avistamiento de la ballena franca autral y habitáculo de lobos marinos, elefantes marinos y pinguinos magallánicos. El vuelo toma 1 hora y 30 minutos.
La ciudad de Viedma, también sobre el atlántico, es el punto de llegada a los encantadores balnearios del sur como Las Grutas, El Pescadero, Playa Bonita, Balneario La Lobería, Bahía Rosas ola Reserva Provincial Punta Bermeja. El vuelo toma 1 hora y 30 minutos.
El nuevo aeropuerto de El Calafate también recibe vuelos regulares desde Buenos Aires. Es el punto de acceso para visitar tanto el Parque Nacional de los Glaciares, El Parque Perito Moreno y Monumento natural de los bosques petrificados. La duración del vuelo es de 3 horas.
Finalmente la ciudad de Ushuaia -la ciudad más autral del mundo- tiene su aeropuerto a orillas del canal del Beagle. Es el punto de llegada para recorrer la isla de Tierra del Fuego tanto en invierno (deportes invernales) como en verano con caminatas por los distintos puntos turísticos. El vuelo a Ushuaia toma 3 horas y 45 minutos.
Tanto las líneas aéreas argentinas como internacionales operan en la región ofreciendo vuelos directos y regulares a cada una de las ciudades. | 
